1、功能：
加工區的功能單一，僅限于產品外銷的加工業務。但區內可設立少量為加工企業生產提供服務的倉儲企業以及經 海關 核準專門從事區內貨物進、出的運輸企業；保稅區的功能為：加工、貿易、倉儲及展覽。
2、退稅政策：
國內原料、物料等進入加工區視同出口， 海關 按照對出口貨物的有關規定車理報關手續，并在貨物辦理入區報關環節簽發 出口退稅 報關單 ，區外企業憑 報關單 出口退稅 聯及有關憑證向稅務部門辦理出口退（免）稅手續；
進入保稅區的國內貨物，必須等貨物實際離境后，才能辦理 出口退稅 手續；
3、成品內銷政策：
加工區銷往境內區外的貨物， 海關 按照對進口貨物的有關規定辦理報關手續，并按制成品征稅。
保稅區內銷的貨物，海關根據貨物的實際情況，作分別處理。只有當內銷成品完全由進口料件組成時，才按成品征稅。
4、國內稅收政策上：
國家對區內加工出口的產品和應稅勞務免征增值稅、消費稅。
保稅區內國家對應稅勞務沒有免稅優惠。
