關稅制度
印度尼西亞對進口商品的關稅分以下4類征收：
1.
A類商品。為國內必要的進口商品，包括稻米、面粉、某些鋼鐵制品、某些化纖產品、棉花、藥材、農業機械設備等。這類商品的進口關稅率大部分在5～40％之間。
2. B類商品。為一些工業產品必需的零部件和材料，進口關稅率為5～35％。
3. C類商品。為國內市場需求不大或國內相關企業需要進口保護的商品。此類商品的進口關稅較A類、B類商品要高。
4. D類商品。為奢侈品、某些消費品，以及國內可以生產，應加以進口保護的商品。此類進口商品所征收的關稅最高。 進口管制
1.
進口許可證。一般不需要，有些貨物需要商業部的特別許可證，個別貨物禁止進口，某些貨物只有經授權的獨家代理商方可辦理進口。對許多貨物還有進口壟斷措施及配額規定。
2. 單證要求。
(1)
商業發票。份數不等，發票上必須寫明出口商和收貨人的姓名和地址，發運的地點和時間，貨運件的標記、序號、數量和種類，每件貨物的重量和內容，并附有詳細的商品名稱和海關稅則編號。
(2)
原產地證明書。沒有統一要求，只是印尼官方機構保留對個別情況下要求提供原產地證明書的權力。產地證需要3個原始件和2個副本。(3)
其他單證。檢驗報告(LKP=Laporan Kebenaran Pemeri
Kssan)要求所有貨物在發運之前必須經過質量、數量、價格檢查。其中有些貨物屬例外，如價值在5000美元以下的特品、原油、石油、貴金屬、寶石藝術品等。
3.
商品檢驗。印尼對凡價值在5000美元以上的進口商品，絕大多數都要進行質量和數量檢驗。當需要對進口商品進行裝船前檢驗時，印尼的相關部門會向出口國的檢驗代理人提供咨詢性文件(包括進口許可證及其它特別文件)，憑借這些文件，檢驗代理人將同賣方聯系，安排出口商品檢驗。此時賣方必須提供價格表、產品性能說明書、正式發票副本以及檢驗代理人所必需的其他文件。賣方還應提供裝貨清單和提單等相關單據的副本。在檢驗完畢且要求的進口單據完備的情況下，進口檢驗代理人將出具檢驗結果報告。
4.
有關包裝的特殊規定。對食品、飲料、陶瓷、玻璃器皿、家庭用品、紡織品和肥皂，必須以生產者的原包裝發運，并且按貨物的種類、性能和商標分別包裝，還要在貨物原裝上明顯標出貨物的種類、數量、重量、商標等內容。此外，還應考慮到印尼的氣候狀況，特別注意防水和防銹。
5.
海關對滯存貨的處理。到達印尼的貨物必須在30天內完稅。在雅加達港，貨物超過期限后，將被送往有關監督機構的簡易倉庫，該機構隸屬于國家港務公司。貨物在那里可存放1～3個月，逾期不取的，在港務局的倉庫里拍賣，拍賣所得用于支付倉儲費。對扣除了拍賣費用后的余額保留3年，3年后仍無人認領，則上繳印尼國庫，貨物在繳納關稅之前不允許退回。
保稅區及其管理制度
目前，印尼已建有100多個工業區，有些與自由貿易區相結合，形成了保稅區。印尼現有10多個保稅區，貨物由印尼海關領域以外的地區進入保稅區，不視為進口，也無須繳納關稅或其他出口稅；供加工或再出口等用途進口的各種原料或成品可自由進入保稅區，不受印尼國內禁止進口規定的限制；由印尼或印尼以外地區輸往保稅區的商品或原料，不論其用途是供直接消費，還是在保稅區內加工或暫時儲存，其在印尼國內的貨物稅、增值稅、關稅及其他稅收皆可免征；保稅區內加工的產品，原則上以外銷為主；凡經印尼政府核準在保稅區內設立的企業，皆可享受進口關稅、進口貨物稅、扣繳稅及國內貨物稅等各項稅收的減免優惠待遇。另外，企業以合并或股票上市的方式擴大規模，仍可享受減免資本貨物及原料或輔料增值稅的退稅待遇。如果資本貨物的產權被轉讓或用于其它用途，則不能享受該項免稅或退稅待遇。
